1.稳定性
 
Linux系统是众所周知最具稳定性的系统;事实上，以Linux系统的美国服务器用户在出现系统崩溃的反馈上比例非常少。这对于用户来说，特别是小型和中小型企业的用户特别有价值，因为服务器系统一旦崩溃对企业的业务会造成很大的影响。
 
与windows相比，Linux处理不运行的进程的能力远高于windows，因为正是这些进程影响了windows的稳定性的主要因素。
 
再有就是重新启动的方面上来说。Windows配置更改通常需要重新启动-造成不可避免的停机时间。而Linux操作系统一般不需要重新启动，几乎所有的Linux配置变化可以在系统运行时进行，并不会影响相关的服务。
 
同样的，而Windows服务器必须经常频繁地进行碎片整理，而在Linux服务器上就很少需要进行这一步处理。
 
2.安全
 
Linux是天生就比Windows更具安全性，无论是从服务器系统，桌面上或在嵌入式环境Linux系统都更具安全性。因为Linux是基于Unix所发展的，从一开始就设计成一个多用户操作系统。只有管理员或root用户，具有管理权限，和更少的用户和应用程序有权限访问内核。这样的设计使得Linux无论在管理上还是在安全上都更加规范。
 
当然，Linux受到攻击较少受到病毒和恶意软件的频率更加小，如果存在漏洞时，往往会更加容易被发现。在Linux的世界中，没有出现过已经潜伏了超过六年的内核漏洞。
 
在内部，同时，Windows系统的用户有时会隐藏在系统管理员的文件。而在Linux服务器上上，系统管理员总能对所有的文件可见，并且这些文件始终处于受控状态。
 
3.硬件
 
而Windows服务器通常需要频繁的硬件升级，以容纳不断增加的资源需求，Linux服务器更灵活性和可扩展性，无论处理器或机器架构都能很好地进行资源上的容纳。
 
如果企业有需要时，也很容易对Linux服务器进行重新配置，从而进一步减少了内存的需求，从而提高性能并保持事情就更简单了。
 
4.TCO
 
因为软件本身是免费，因而Linux服务器在应用开发上更能节约成本。即使有企业购买了专业的版本，但是在性价比上它也比window或者其他系统更加高因为它通常包括基于用户的许可和一系列昂贵的附加组件，尤其是在服务器的安全机制上。
 
5.自由
 
Linux服务器更具自由性，无论用户选择什么样的业务，都可以用Linux系统对业务进行更加自由的开发。